More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0698 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  100 
 
 
383 aa  733    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  37.1 
 
 
372 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  38.83 
 
 
388 aa  202  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.46 
 
 
356 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  31.84 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 
365 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
352 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.12 
 
 
355 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  31.28 
 
 
365 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.98 
 
 
352 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  33.15 
 
 
403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  32.41 
 
 
344 aa  163  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.03 
 
 
381 aa  163  6e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 
352 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  30.93 
 
 
352 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  31.49 
 
 
367 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  33.13 
 
 
391 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  30.98 
 
 
365 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  32.77 
 
 
344 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  32.77 
 
 
344 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
352 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  31.88 
 
 
352 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  31.88 
 
 
352 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  29.71 
 
 
371 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  32.05 
 
 
344 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
352 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 
352 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  28.53 
 
 
371 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  28.79 
 
 
442 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  32.09 
 
 
364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  32.27 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.49 
 
 
471 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  28.38 
 
 
357 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  29.1 
 
 
362 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
354 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
408 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
354 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
451 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  32.15 
 
 
454 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.78 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.25 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.45 
 
 
373 aa  140  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  31.13 
 
 
415 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  31 
 
 
426 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  34.12 
 
 
410 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
441 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  30.06 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  32.74 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  31.98 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  31.8 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.61 
 
 
419 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  29.09 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
383 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 
365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  29.05 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  29.49 
 
 
379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  25.72 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  31.53 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
413 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
852 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  25.44 
 
 
343 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  31.11 
 
 
528 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  27.22 
 
 
338 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.53 
 
 
372 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  30.24 
 
 
409 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
376 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  28.29 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  27.99 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  25.91 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  27.7 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1651  inner-membrane translocator  31.49 
 
 
624 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.758453 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  29.97 
 
 
353 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
363 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  24.33 
 
 
349 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  31.72 
 
 
463 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  27.17 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  30.4 
 
 
375 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  29.49 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  29.45 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  26.61 
 
 
359 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  27.06 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  28.74 
 
 
379 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  25.55 
 
 
340 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  26.36 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  25.85 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  25.95 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  27 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  27.61 
 
 
349 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  28.12 
 
 
365 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  28.33 
 
 
376 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  31.3 
 
 
365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  26.69 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  27.49 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  27.3 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  27.18 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>