More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1690 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  100 
 
 		 665 aa  1287    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0638  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 613 aa  326  8.000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1651  inner-membrane translocator  43.59 
 
 		 624 aa  310  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.758453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  33.41 
 
 		 391 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.04 
 
 		 344 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.04 
 
 		 344 aa  169  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 		 365 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.97 
 
 		 365 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 367 aa  164  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 354 aa  161  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 354 aa  161  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  32.46 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 376 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  31.98 
 
 		 365 aa  156  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 426 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 376 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 403 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.11 
 
 		 417 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 367 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  29.16 
 
 		 376 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.07 
 
 		 471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.92 
 
 		 419 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 371 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 372 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 413 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 348 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 371 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 364 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 367 aa  127  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  28.07 
 
 		 373 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 344 aa  125  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  37.88 
 
 		 441 aa  125  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  31 
 
 		 364 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 400 aa  124  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 352 aa  124  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.35 
 
 		 427 aa  124  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 352 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 370 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 379 aa  117  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 362 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  59.09 
 
 		 437 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 338 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  28.64 
 
 		 377 aa  114  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  25.64 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 364 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 410 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  41.54 
 
 		 344 aa  105  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 377 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.65 
 
 		 442 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  39.23 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.31 
 
 		 373 aa  99.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  34.6 
 
 		 352 aa  98.2  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  34.6 
 
 		 352 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 351 aa  98.2  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 352 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 365 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 414 aa  97.4  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 352 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 352 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 350 aa  95.1  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  35.66 
 
 		 368 aa  94.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 		 355 aa  94  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 368 aa  94  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 338 aa  94  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  30.05 
 
 		 380 aa  93.6  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  24.74 
 
 		 360 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  27.25 
 
 		 359 aa  92.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  46.51 
 
 		 408 aa  91.3  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.82 
 
 		 544 aa  91.3  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 365 aa  90.9  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  51.04 
 
 		 365 aa  90.1  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 350 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 369 aa  89  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  25.94 
 
 		 387 aa  89  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 361 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  53.26 
 
 		 388 aa  88.2  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 371 aa  88.2  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  40.74 
 
 		 454 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  40.87 
 
 		 415 aa  88.2  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 409 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 358 aa  87.8  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 355 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  41.91 
 
 		 367 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 357 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>