289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0638 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0638  inner-membrane translocator  100 
 
 
613 aa  1170    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1651  inner-membrane translocator  62.81 
 
 
624 aa  609  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.758453 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  45.28 
 
 
665 aa  338  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.83 
 
 
442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  33.9 
 
 
377 aa  140  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  32.68 
 
 
437 aa  127  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
344 aa  118  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
344 aa  118  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  29.45 
 
 
448 aa  114  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.22 
 
 
365 aa  114  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.68 
 
 
365 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  26.71 
 
 
357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
354 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
354 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  46 
 
 
391 aa  112  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  42.94 
 
 
410 aa  110  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
365 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  33.33 
 
 
372 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  28.05 
 
 
371 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  39.13 
 
 
376 aa  107  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  33.2 
 
 
352 aa  107  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  44.59 
 
 
376 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  41.89 
 
 
365 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  31.11 
 
 
367 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  31.98 
 
 
352 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  37.86 
 
 
370 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  34.91 
 
 
344 aa  104  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  36.49 
 
 
415 aa  104  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  44.03 
 
 
379 aa  104  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  40.67 
 
 
367 aa  104  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.85 
 
 
371 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  26.64 
 
 
351 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  38.55 
 
 
338 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.81 
 
 
403 aa  103  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  39.43 
 
 
462 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  32.93 
 
 
364 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  35.18 
 
 
352 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  42.57 
 
 
340 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
352 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  38.29 
 
 
417 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  33.98 
 
 
352 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  33.98 
 
 
352 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
352 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  43.62 
 
 
367 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  32.9 
 
 
441 aa  100  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  45.79 
 
 
358 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 
352 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
352 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  45.52 
 
 
362 aa  99.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
352 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
362 aa  98.2  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
348 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  38 
 
 
365 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
365 aa  97.4  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.13 
 
 
344 aa  97.8  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  26.52 
 
 
373 aa  97.4  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.62 
 
 
426 aa  97.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  41.86 
 
 
356 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
414 aa  97.1  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
451 aa  96.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 
383 aa  95.1  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  48.1 
 
 
364 aa  95.1  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  41.22 
 
 
376 aa  94.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.31 
 
 
364 aa  94.4  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  38.18 
 
 
365 aa  93.6  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  46.84 
 
 
364 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  24.78 
 
 
359 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.31 
 
 
471 aa  93.6  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  44.26 
 
 
377 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
372 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  50.71 
 
 
392 aa  90.9  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  25.67 
 
 
387 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
350 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  28.91 
 
 
377 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  46.2 
 
 
364 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.14 
 
 
355 aa  90.5  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  33.25 
 
 
367 aa  90.5  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.39 
 
 
352 aa  90.1  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  39.31 
 
 
427 aa  88.2  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  46.96 
 
 
544 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  49.52 
 
 
454 aa  87.8  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32 
 
 
358 aa  86.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  33.86 
 
 
379 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  29.94 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  39.33 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  39.04 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  33.73 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  33.15 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.26 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  38.79 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  24.94 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  39.06 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.18 
 
 
353 aa  84  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
357 aa  84  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  37.24 
 
 
338 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
380 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.65 
 
 
419 aa  83.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>