More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1139 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  90.41 
 
 		 462 aa  703    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  100 
 
 		 417 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  54.85 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  57.29 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  53.01 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  59.1 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  57.22 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  54.85 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  53.93 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  49.39 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  52.45 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  54.76 
 
 		 408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  49.87 
 
 		 544 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  50.39 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  47.25 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 442 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  42.73 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  38.48 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  44.51 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 352 aa  217  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 354 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 354 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  40.79 
 
 		 357 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  35.68 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 344 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  41 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 348 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 352 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 352 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 388 aa  173  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 376 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  41.12 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 		 365 aa  167  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  40 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  40 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.1 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  38.32 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  41.51 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 355 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  35.08 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  33.15 
 
 		 366 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  35.56 
 
 		 369 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  33.44 
 
 		 372 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 363 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  38.21 
 
 		 349 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 		 355 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  43.57 
 
 		 340 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  33 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.29 
 
 		 373 aa  144  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 409 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 364 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 		 347 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  39.38 
 
 		 347 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  32.98 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 371 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 364 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.55 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.29 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>