More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1354 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  100 
 
 		 413 aa  806    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  49.42 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  58.52 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  44.87 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  51 
 
 		 471 aa  243  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  42.3 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  41.49 
 
 		 419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 462 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  45.29 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  47.77 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  46.04 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  43.94 
 
 		 454 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 344 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  36.87 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 352 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  43.22 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.16 
 
 		 357 aa  183  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  37.07 
 
 		 365 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 352 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  44.65 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  41.02 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  45.51 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  30.41 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.62 
 
 		 364 aa  166  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  33.51 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  36.62 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  36.62 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  29.72 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.52 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.35 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 360 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 665 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 334 aa  144  4e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.08 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  32.6 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 463 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 364 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 363 aa  130  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  36.3 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.24 
 
 		 369 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>