More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2945 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  100 
 
 
415 aa  793    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  64.41 
 
 
451 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  58.77 
 
 
419 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  59.07 
 
 
427 aa  381  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  57.14 
 
 
414 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  55.36 
 
 
462 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  56.14 
 
 
471 aa  364  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  54.5 
 
 
454 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  54.11 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  50.12 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  47.61 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  49.3 
 
 
544 aa  299  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  54.74 
 
 
408 aa  298  8e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  48.29 
 
 
441 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  45.43 
 
 
410 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  44.94 
 
 
413 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
442 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  43.34 
 
 
371 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  33.57 
 
 
391 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
371 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  38.76 
 
 
352 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
344 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.84 
 
 
365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  35.66 
 
 
357 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
344 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
344 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
354 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
354 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  43.11 
 
 
379 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.2 
 
 
365 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  36.7 
 
 
356 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
365 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.55 
 
 
352 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  37.24 
 
 
348 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 
352 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
352 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
357 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.69 
 
 
388 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  39.3 
 
 
344 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
352 aa  167  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  39.66 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  38.82 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  38.82 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 
352 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 
352 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 
383 aa  161  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
367 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
365 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.15 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.89 
 
 
362 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  37.81 
 
 
371 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
369 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  36.71 
 
 
369 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  37.3 
 
 
365 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32.37 
 
 
364 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  36.01 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  33.71 
 
 
364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  30.94 
 
 
363 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
355 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  36.88 
 
 
387 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  30.75 
 
 
373 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.5 
 
 
355 aa  144  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.43 
 
 
360 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  41.49 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.89 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
352 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.7 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  33.87 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.37 
 
 
366 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.4 
 
 
367 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  33.13 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  34.2 
 
 
376 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  30.22 
 
 
340 aa  136  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.57 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  34.12 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  34.39 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  36.76 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  34.54 
 
 
376 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
351 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  37.13 
 
 
347 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1592  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
334 aa  133  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
383 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.75 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  36.07 
 
 
361 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
377 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
343 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.67 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  35.79 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.41 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>