More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2070 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  100 
 
 
348 aa  687    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  82.58 
 
 
356 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  59.48 
 
 
352 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  59.18 
 
 
352 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  59.18 
 
 
352 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  58.6 
 
 
352 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  59.18 
 
 
352 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  59.18 
 
 
352 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  59.18 
 
 
352 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  59.18 
 
 
352 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  59.18 
 
 
352 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  46.65 
 
 
373 aa  285  8e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  42.77 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  45.35 
 
 
365 aa  272  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  43.23 
 
 
365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 
365 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  46.09 
 
 
391 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  43.34 
 
 
352 aa  262  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  41.03 
 
 
381 aa  259  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  40.06 
 
 
364 aa  256  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3639  branched-chain amino acid transport system, permease, N-terminus  59.18 
 
 
249 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  43.97 
 
 
353 aa  249  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  38.7 
 
 
372 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
371 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  39.54 
 
 
357 aa  235  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  38.37 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  37.75 
 
 
442 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  42.41 
 
 
344 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  40.35 
 
 
344 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  40.35 
 
 
344 aa  226  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  38.84 
 
 
357 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  41.23 
 
 
371 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  38.23 
 
 
400 aa  216  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  39.2 
 
 
388 aa  208  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  36.11 
 
 
358 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  40.7 
 
 
344 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  46.26 
 
 
426 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  37.18 
 
 
403 aa  205  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  41.18 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  43.35 
 
 
370 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  43.06 
 
 
365 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  36.47 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  36.47 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  42.25 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
343 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
365 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  37.01 
 
 
364 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  39.67 
 
 
437 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.91 
 
 
471 aa  192  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
451 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
367 aa  192  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  38.21 
 
 
454 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
340 aa  189  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 
383 aa  187  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  40.89 
 
 
462 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
373 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  42.41 
 
 
408 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  40.21 
 
 
417 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  39.4 
 
 
365 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  32.73 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  38.58 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  36.64 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  36.89 
 
 
364 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  35.43 
 
 
372 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  38.8 
 
 
415 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  40 
 
 
376 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
475 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  38.68 
 
 
409 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  41.52 
 
 
419 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
441 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  36.25 
 
 
376 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  35.85 
 
 
347 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  39.17 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  35.38 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
367 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
448 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  40.75 
 
 
340 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  37.18 
 
 
349 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  36.83 
 
 
349 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  36.24 
 
 
414 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
363 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  30.51 
 
 
366 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.91 
 
 
349 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.82 
 
 
366 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
355 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  30.72 
 
 
368 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
338 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
362 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  41.02 
 
 
413 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  39.19 
 
 
410 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.07 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  34.37 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  32.54 
 
 
354 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>