More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1077 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  100 
 
 		 360 aa  702    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  35.77 
 
 		 365 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 442 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 362 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.54 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 373 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.56 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 356 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.21 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  31.41 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.22 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  29.41 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.66 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.4 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  32.58 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.91 
 
 		 349 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.53 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 367 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 426 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.82 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  30.54 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 349 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  27.81 
 
 		 355 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.1 
 
 		 419 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  29.62 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  29.62 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6252  inner-membrane translocator  29.27 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 380 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 375 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  30.82 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>