298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0917 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  100 
 
 
351 aa  694    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  33.14 
 
 
371 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  34.34 
 
 
344 aa  159  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.14 
 
 
365 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.36 
 
 
357 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  28.81 
 
 
391 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.88 
 
 
371 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
343 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  30.46 
 
 
365 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.72 
 
 
360 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.56 
 
 
365 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  32.74 
 
 
354 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  32.74 
 
 
354 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  29.69 
 
 
367 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  29.85 
 
 
362 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6252  inner-membrane translocator  29.9 
 
 
339 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.64 
 
 
352 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  30.36 
 
 
375 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  30.93 
 
 
348 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  30.82 
 
 
352 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  32.08 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  32.08 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  29.02 
 
 
357 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.78 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.98 
 
 
471 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
454 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  28.33 
 
 
340 aa  133  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  30.25 
 
 
451 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  29.01 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  30.5 
 
 
365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  33.53 
 
 
370 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  27.64 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.96 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  31.72 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.55 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
352 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
363 aa  126  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  29.2 
 
 
353 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  32.02 
 
 
352 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  32.02 
 
 
352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
352 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  27.45 
 
 
365 aa  123  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  29.82 
 
 
462 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  30.3 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0906  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222842  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  29.37 
 
 
415 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
417 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  25.9 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  27.84 
 
 
364 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  31.91 
 
 
344 aa  116  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
365 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.16 
 
 
372 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  28.84 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  31.73 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  29 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  29.37 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  29.97 
 
 
419 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  26.63 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  27.79 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  23.63 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
345 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  25.76 
 
 
375 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  26.97 
 
 
362 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  30.9 
 
 
426 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.09 
 
 
364 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.03 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  25.49 
 
 
361 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  26.91 
 
 
372 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  25.71 
 
 
371 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  28.07 
 
 
376 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  28.87 
 
 
377 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  27.66 
 
 
347 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  26.89 
 
 
369 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  27 
 
 
358 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  25.43 
 
 
353 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  26.28 
 
 
369 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  29.79 
 
 
350 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  23.64 
 
 
355 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  24.78 
 
 
442 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  28.14 
 
 
338 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  31.46 
 
 
414 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  27 
 
 
364 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  25.35 
 
 
403 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.51 
 
 
349 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  31.94 
 
 
408 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  24.7 
 
 
364 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.93 
 
 
381 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  29.75 
 
 
528 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  26.28 
 
 
369 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  26.78 
 
 
369 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 
360 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  28.11 
 
 
376 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.8 
 
 
348 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  25 
 
 
369 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1415  inner-membrane translocator  30.65 
 
 
448 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>