More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0906 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0906  inner-membrane translocator  100 
 
 		 344 aa  664    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222842  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  32.94 
 
 		 391 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 364 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 352 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.3 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  31.09 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.75 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  30.7 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 377 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  28.12 
 
 		 368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  28.36 
 
 		 343 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 367 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.57 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.87 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0005  putative ABC transporter, permease protein  28.27 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.226328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  28.97 
 
 		 361 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.67 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  28.12 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  28.29 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  29.78 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.31 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.62 
 
 		 471 aa  113  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  30.4 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  30 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  26.14 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  29.52 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  31.61 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 528 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 354 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 354 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  29.49 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 451 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.91 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  30.49 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1168  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  28.1 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  28.66 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 355 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 351 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>