More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0005 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  93.31 
 
 		 359 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0005  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 336 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.226328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  89.42 
 
 		 363 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 347 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 347 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 349 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 347 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.82 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.99 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  28.44 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 351 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  29.23 
 
 		 363 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 353 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  26.36 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  25.63 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  27.36 
 
 		 358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.56 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  27.22 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  25.86 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  25.23 
 
 		 369 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  26.88 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  24.86 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1646  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.12829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  28.52 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  26.89 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  26.89 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  26.57 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  27.99 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  26.44 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  29.45 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  25.42 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  24.48 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  30.13 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  25.16 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  26.48 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  27.39 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  27.2 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  27.74 
 
 		 369 aa  99  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  26.61 
 
 		 367 aa  99  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  27.24 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 383 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  25.3 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  28.45 
 
 		 372 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  26.83 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  24.57 
 
 		 400 aa  97.1  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  27.41 
 
 		 357 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0852  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  25.08 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 408 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 426 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  27.27 
 
 		 367 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  27.83 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  27.18 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  28.86 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  25.23 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0837  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 451 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>