More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0852 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0852  inner-membrane translocator  100 
 
 		 362 aa  702    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  53.35 
 
 		 375 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  53.49 
 
 		 375 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  54.87 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  54.89 
 
 		 392 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  53.1 
 
 		 353 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1116  inner-membrane translocator  50.74 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5242  inner-membrane translocator  54.63 
 
 		 371 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1369  ABC transporter, inner membrane subunit  54.31 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0719579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1168  inner-membrane translocator  50.29 
 
 		 369 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3025  inner-membrane translocator  56.23 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0768  ABC transporter permease protein  54.88 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1359  ABC transporter, permease protein  49.71 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1702  inner-membrane translocator  50 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.122598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0837  inner-membrane translocator  51.37 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2021  inner-membrane translocator  50 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 373 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 371 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.87 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 366 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  33.23 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.8 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 347 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.15 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.62 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  24.72 
 
 		 359 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 363 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 354 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  32.48 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 361 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  32.4 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  28.1 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  29.81 
 
 		 367 aa  136  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 417 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  30.9 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  28.53 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  32.76 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  30.52 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 357 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 462 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  32.53 
 
 		 387 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  30.55 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>