More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0768 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0768  ABC transporter permease protein  100 
 
 		 365 aa  695    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  77.78 
 
 		 353 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0837  inner-membrane translocator  73.12 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  58.98 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  58.61 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  57.75 
 
 		 375 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1168  inner-membrane translocator  56.74 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  57.63 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1369  ABC transporter, inner membrane subunit  58.68 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0719579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5242  inner-membrane translocator  59.69 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1359  ABC transporter, permease protein  56.78 
 
 		 370 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0852  inner-membrane translocator  54.88 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1116  inner-membrane translocator  55.18 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3025  inner-membrane translocator  57.45 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2021  inner-membrane translocator  56.51 
 
 		 385 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1702  inner-membrane translocator  56.21 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.122598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 357 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  29.14 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34.92 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  33.56 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  28.69 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 362 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.58 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  32.34 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  32 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  27.4 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  25.15 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  32.3 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  34.74 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.55 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.91 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  30.3 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0005  putative ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.226328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  32.25 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.79 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  29.8 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  30 
 
 		 348 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.66 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  27.01 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  34.1 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  26.07 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  27.35 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>