More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4443 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  96.1 
 
 		 359 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  705    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0005  putative ABC transporter, permease protein  89.42 
 
 		 336 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.226328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.42 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 442 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 349 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.11 
 
 		 349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  31.48 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  28.7 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  30.56 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  27.22 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  32.49 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  28.14 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.69 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  28.83 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  28.13 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  30.63 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  30.59 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  29.78 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  26.63 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  30.87 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  27.02 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  27.96 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  27.13 
 
 		 372 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  28.45 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  29.22 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 344 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  29.66 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  30 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  28.14 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  29.28 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.8 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6252  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  27.46 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  30.16 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  27.11 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  26.04 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  25.68 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  29.14 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>