More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3944 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  96.67 
 
 		 360 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  96.11 
 
 		 360 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  77.4 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  73.54 
 
 		 360 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  71.19 
 
 		 361 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  66.2 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  53.2 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  47.03 
 
 		 361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  46.74 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  47.88 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  48.01 
 
 		 364 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  51.25 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  47.03 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  45.38 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  45.04 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  46.74 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  43.18 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 369 aa  275  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  44.82 
 
 		 366 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  44.75 
 
 		 369 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  45.92 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  45.48 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  46.76 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  44.93 
 
 		 368 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  46.18 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 369 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  45.68 
 
 		 369 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  45.33 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  44.16 
 
 		 363 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  44.9 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 350 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  46.91 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  42.06 
 
 		 387 aa  248  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  45.61 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  45.09 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  45.89 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  44.82 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  40.56 
 
 		 366 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 365 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.85 
 
 		 360 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.29 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  32.38 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  37.61 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.62 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.19 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 371 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  28.29 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 451 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  28.91 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  27.59 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>