More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0766 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  100 
 
 		 366 aa  732    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  51.87 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  41.74 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  40.83 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 361 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  33.7 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.08 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  34.75 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 355 aa  185  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 355 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  38.41 
 
 		 349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 349 aa  176  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.49 
 
 		 366 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 369 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  33.43 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  28.82 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 391 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  29.89 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  29.53 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 349 aa  170  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  29.59 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 364 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 355 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.7 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  29.69 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  28.98 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  30.5 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  32.19 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  30.72 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  31.21 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  32.85 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  27.97 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  33.23 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  30.28 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.31 
 
 		 355 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  30 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  29.43 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.14 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 362 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  30.27 
 
 		 359 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  29.17 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 365 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>