More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1926 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  100 
 
 		 354 aa  686    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  80.06 
 
 		 357 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  73.8 
 
 		 355 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  64.96 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  64.67 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 373 aa  272  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 359 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 369 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 363 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 		 360 aa  192  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  37.04 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 368 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.7 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  37.39 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 359 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 363 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 357 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  33.61 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  35.73 
 
 		 355 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.14 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  38.91 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  33.62 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 369 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  34.99 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.2 
 
 		 369 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  34.09 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  37.3 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  35 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 369 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.88 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1168  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  39.29 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  35.63 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  36.34 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1359  ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 380 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  38.7 
 
 		 365 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 356 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 371 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.84 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>