More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3150 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  100 
 
 		 361 aa  693    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  59.08 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1245  inner-membrane translocator  59.31 
 
 		 350 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.138626 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  55.98 
 
 		 348 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  39.34 
 
 		 349 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 357 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.95 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.66 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  43.22 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.91 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 355 aa  149  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0527  inner-membrane translocator  39.66 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  31.87 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4347  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  32.46 
 
 		 352 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  32.78 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.7 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 360 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 361 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  32.78 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 361 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  33.52 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  40.08 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 363 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.58 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  40.39 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 383 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  33.43 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.05 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  32.41 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 354 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 360 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.85 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  32.48 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 368 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 357 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  30.21 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 376 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.53 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  31.6 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  32.64 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 369 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>