More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0820 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  100 
 
 		 344 aa  672    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  100 
 
 		 344 aa  672    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  70.06 
 
 		 344 aa  484  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  67.93 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  66.77 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  45.82 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  42.6 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  42.15 
 
 		 357 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  40.69 
 
 		 352 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  42.15 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  41.83 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  41.26 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  38.3 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  39.42 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  40.35 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  37.61 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 356 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  40.12 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 352 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  36.98 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  40.61 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 343 aa  212  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  39.08 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  39.08 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  38.58 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  36.55 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  39.48 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  38.51 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  38.51 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 454 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  40 
 
 		 419 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  41.74 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  37.39 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  35.29 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  41.62 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.51 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 388 aa  192  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 376 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 426 aa  192  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.91 
 
 		 364 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.99 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 364 aa  185  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2517  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  28.94 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  33.62 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  33.72 
 
 		 376 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.66 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.43 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  27.79 
 
 		 368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 528 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 362 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.58 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  35.43 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  33.53 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  31.2 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  31.43 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>