More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0403 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  100 
 
 
352 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  61.93 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  53.85 
 
 
357 aa  357  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  45.11 
 
 
344 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  43.77 
 
 
365 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  40.97 
 
 
391 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  41.62 
 
 
371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
344 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
344 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  40 
 
 
373 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  40.86 
 
 
371 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  36.76 
 
 
362 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  43.06 
 
 
348 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  40.34 
 
 
352 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  41.81 
 
 
356 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
364 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
442 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 
352 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 
352 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  38.68 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  39.09 
 
 
338 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
365 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
365 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  39.83 
 
 
352 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  36.75 
 
 
365 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.03 
 
 
355 aa  212  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  41.27 
 
 
427 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  42.32 
 
 
451 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  39.83 
 
 
352 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  39.83 
 
 
352 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  39.83 
 
 
352 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  40.95 
 
 
419 aa  205  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  36.2 
 
 
343 aa  205  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
352 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.89 
 
 
364 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
352 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  40.25 
 
 
350 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.22 
 
 
373 aa  200  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  35.94 
 
 
372 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  40 
 
 
417 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  42.98 
 
 
370 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
365 aa  199  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  40.44 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  35.25 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
365 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  38.2 
 
 
354 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  38.2 
 
 
354 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  37.86 
 
 
365 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
454 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
379 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  36.68 
 
 
358 aa  192  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.41 
 
 
471 aa  189  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  34.55 
 
 
340 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.82 
 
 
354 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  35.17 
 
 
353 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.21 
 
 
349 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
359 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  39.67 
 
 
426 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  37.93 
 
 
349 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
360 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  36.64 
 
 
347 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  34.76 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  39.29 
 
 
415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.98 
 
 
381 aa  179  8e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  32.85 
 
 
364 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
349 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  34.73 
 
 
377 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  37.42 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  30.13 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  35.69 
 
 
388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  37.92 
 
 
353 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  40.14 
 
 
414 aa  172  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  34.42 
 
 
355 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  33.53 
 
 
376 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
360 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  29.73 
 
 
368 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  29.65 
 
 
366 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.36 
 
 
366 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.98 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.2 
 
 
347 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  34.4 
 
 
367 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  30.99 
 
 
363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 
360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
354 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
410 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
361 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
349 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.63 
 
 
367 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  31.99 
 
 
363 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
376 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  33.8 
 
 
364 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  30.56 
 
 
355 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>