More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4467 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  100 
 
 		 366 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  93.96 
 
 		 366 aa  627  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  51.41 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  51.41 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  50.87 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  48.12 
 
 		 351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  49.43 
 
 		 369 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 369 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  50 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  50.57 
 
 		 369 aa  298  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  49.27 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  46.88 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  48.98 
 
 		 359 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  48.41 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  48.94 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  49.23 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  47.98 
 
 		 360 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  44.6 
 
 		 368 aa  281  9e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  46.65 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  49.71 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  43.96 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  46.8 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  46.48 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  48.7 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  46.2 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.44 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  42.24 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  43.1 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  42.54 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  41.79 
 
 		 363 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  39.77 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  40.35 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  43.66 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  41.41 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  41.1 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  42.81 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  45.05 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  44.71 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  43.84 
 
 		 356 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  43.68 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  36.34 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  36.92 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.7 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.01 
 
 		 349 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 349 aa  166  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 347 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  33.53 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.69 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 349 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  33 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  28.44 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.13 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  27.43 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  31.33 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 365 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>