More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2284 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  100 
 
 		 364 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  93.41 
 
 		 364 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  93.41 
 
 		 364 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  77.6 
 
 		 372 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  73.13 
 
 		 364 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  79.73 
 
 		 392 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  68.96 
 
 		 362 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  58.33 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  53.42 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  59.83 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  53.28 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  54.5 
 
 		 376 aa  358  8e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  53.7 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  56.53 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  53.02 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  53.71 
 
 		 367 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  37.9 
 
 		 365 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  38.17 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  38.28 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 344 aa  176  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.73 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.61 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  39.82 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 358 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  37.62 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.07 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  33.52 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 426 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 437 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  32.54 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  38.79 
 
 		 345 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  37.59 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.61 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.38 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.79 
 
 		 471 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.24 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  32.84 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 350 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  35.26 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.05 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.86 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 368 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.72 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  30.06 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.23 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32 
 
 		 364 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.73 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  36.5 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  34.05 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  29.17 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  31 
 
 		 665 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  30.38 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>