More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4401 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  100 
 
 		 400 aa  746    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  49.17 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  45.31 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 528 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  46.72 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  46.31 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  46.2 
 
 		 375 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  36.57 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 391 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  39.4 
 
 		 365 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  36.87 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 371 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.31 
 
 		 376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 344 aa  169  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 360 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  37.69 
 
 		 364 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 352 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  40.44 
 
 		 370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.73 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  29.78 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 		 352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 367 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  35.29 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 353 aa  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 417 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.01 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.57 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 403 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.58 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  29.36 
 
 		 343 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 463 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 347 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 415 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  37.15 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  37.15 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  35.85 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  35.01 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 365 aa  133  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  31.13 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3150  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 361 aa  133  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.35673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  27.52 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 379 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2078  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0200136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>