More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3653 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  100 
 
 
379 aa  744    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  74.31 
 
 
377 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  64.03 
 
 
367 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  66.85 
 
 
376 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  62.47 
 
 
367 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  60.39 
 
 
365 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  59.61 
 
 
372 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  54.84 
 
 
376 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  55.9 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  53.93 
 
 
377 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  58.13 
 
 
362 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  55 
 
 
364 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  59.83 
 
 
364 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  60.39 
 
 
364 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  60.39 
 
 
364 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  56.16 
 
 
392 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  55.43 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  43.07 
 
 
367 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
365 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
371 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.34 
 
 
344 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
362 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  37.14 
 
 
442 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.89 
 
 
357 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
370 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
344 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  38.17 
 
 
340 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  37.93 
 
 
354 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  37.93 
 
 
354 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.52 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.95 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  32.94 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  35.49 
 
 
342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
365 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.24 
 
 
426 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  38.64 
 
 
379 aa  155  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
665 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  34.55 
 
 
371 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  31.47 
 
 
372 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  33.14 
 
 
358 aa  152  8.999999999999999e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  34.37 
 
 
383 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  37.07 
 
 
350 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  29.61 
 
 
360 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  35.69 
 
 
349 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4401  inner-membrane translocator  38.86 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.31 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  37.78 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  38.1 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  30.3 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  34.34 
 
 
352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  38.02 
 
 
348 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  30.65 
 
 
360 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
368 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  32.68 
 
 
363 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  35.15 
 
 
345 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
352 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 
360 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.69 
 
 
366 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
365 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.1 
 
 
368 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
349 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
350 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
365 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  34.5 
 
 
365 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  29.69 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  33.12 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.74 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.63 
 
 
347 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  29.61 
 
 
364 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
454 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
352 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  35.99 
 
 
427 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.9 
 
 
471 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  30.88 
 
 
365 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  34.38 
 
 
462 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.18 
 
 
361 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.53 
 
 
373 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.02 
 
 
355 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
352 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.48 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  29.24 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  34.82 
 
 
347 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  30.17 
 
 
360 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  29.89 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  28.32 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
528 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  35.26 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.52 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  33.24 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  30.03 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  30.79 
 
 
360 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  30.31 
 
 
369 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>