More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0757 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  100 
 
 		 475 aa  939    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  43.7 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  60.98 
 
 		 371 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  43.15 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  43.75 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  43.75 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  41.95 
 
 		 356 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  41.57 
 
 		 348 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 352 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 354 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 354 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 352 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.75 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 352 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  37.71 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  37.71 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 		 352 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 		 352 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 371 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  34.32 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.51 
 
 		 355 aa  156  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.09 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.95 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  36.79 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 377 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 362 aa  153  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.2 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.29 
 
 		 381 aa  152  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.56 
 
 		 364 aa  150  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.71 
 
 		 344 aa  147  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 383 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 358 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 340 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  33.74 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.71 
 
 		 471 aa  140  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0038  ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 852 aa  137  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  35.89 
 
 		 345 aa  136  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 340 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf822  sugar ABC transporter permease protein  30.21 
 
 		 677 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 343 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  34.21 
 
 		 376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 364 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.06 
 
 		 419 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 353 aa  131  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  34.99 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  38.29 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  32 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  32.07 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  31.59 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 338 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5418  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.33 
 
 		 348 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21260  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.73 
 
 		 544 aa  123  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.801494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  30 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3639  branched-chain amino acid transport system, permease, N-terminus  38.78 
 
 		 249 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 364 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>