More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0957 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0957  inner-membrane translocator  100 
 
 
371 aa  723    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0757  inner-membrane translocator  62.69 
 
 
475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3267  inner-membrane translocator  46.22 
 
 
463 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.169557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  42.33 
 
 
365 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  42.61 
 
 
365 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2257  inner-membrane translocator  44.02 
 
 
409 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  41.29 
 
 
365 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  38.03 
 
 
372 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
391 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  37.75 
 
 
352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
352 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  38.97 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  38.97 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
356 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
352 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
352 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.5 
 
 
365 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  40.06 
 
 
348 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  38.62 
 
 
352 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  38.62 
 
 
352 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
352 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.49 
 
 
355 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 
352 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 
352 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  33.93 
 
 
400 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.14 
 
 
371 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.61 
 
 
357 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.57 
 
 
344 aa  177  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.57 
 
 
344 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  36.5 
 
 
388 aa  172  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.43 
 
 
381 aa  172  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  38.51 
 
 
344 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  35.67 
 
 
367 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.82 
 
 
364 aa  170  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.49 
 
 
373 aa  169  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  38.25 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  34.96 
 
 
371 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.66 
 
 
373 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
403 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.34 
 
 
344 aa  155  7e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  36.7 
 
 
451 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  31.93 
 
 
362 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  36.17 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  31.83 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  32.65 
 
 
343 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  35.15 
 
 
363 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  32.69 
 
 
357 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  32.57 
 
 
441 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  39.72 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.14 
 
 
471 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  33.14 
 
 
377 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  35.02 
 
 
376 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  35.48 
 
 
462 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  36.59 
 
 
454 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  33.62 
 
 
442 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  33.72 
 
 
365 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
383 aa  143  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  29.78 
 
 
358 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.5 
 
 
417 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0956  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.73 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281596  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  30.77 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  31.39 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  33.64 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
364 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  31.8 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  30.29 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  35.98 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  31.8 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  33.68 
 
 
345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  35.21 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
367 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  39.18 
 
 
414 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  30.87 
 
 
364 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  31.45 
 
 
368 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.15 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  36.34 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.87 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1354  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  30.92 
 
 
365 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  33.94 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3639  branched-chain amino acid transport system, permease, N-terminus  37.75 
 
 
249 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.64 
 
 
364 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  36.24 
 
 
345 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  31.09 
 
 
349 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  35.47 
 
 
379 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
370 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  31.51 
 
 
426 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  32.45 
 
 
364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  28.69 
 
 
355 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>