194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3100 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3100  inner-membrane translocator  100 
 
 		 114 aa  221  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  96.33 
 
 		 357 aa  203  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  86.36 
 
 		 359 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  82.73 
 
 		 368 aa  182  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  75.45 
 
 		 370 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  79.09 
 
 		 383 aa  173  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  74.31 
 
 		 360 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  74.55 
 
 		 351 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  80 
 
 		 357 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  71.03 
 
 		 361 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  64.76 
 
 		 354 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  62.86 
 
 		 387 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 361 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  60.2 
 
 		 361 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  55.77 
 
 		 364 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  57.14 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  62.77 
 
 		 364 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 363 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  57.14 
 
 		 360 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  52.88 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  54.9 
 
 		 363 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 369 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  48.15 
 
 		 360 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  49.52 
 
 		 369 aa  107  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  47.86 
 
 		 360 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  47.86 
 
 		 360 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 368 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  49.57 
 
 		 360 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  54.9 
 
 		 355 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  48.6 
 
 		 368 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  61.22 
 
 		 367 aa  104  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 355 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  56.12 
 
 		 358 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 364 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  44.95 
 
 		 361 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  59.18 
 
 		 367 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  48.11 
 
 		 368 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  51.92 
 
 		 362 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  53.27 
 
 		 369 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  54.29 
 
 		 362 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  47.27 
 
 		 356 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 361 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  53.27 
 
 		 369 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  53.33 
 
 		 362 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  53.33 
 
 		 362 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  51.4 
 
 		 369 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  57.43 
 
 		 361 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  47.17 
 
 		 366 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  47.17 
 
 		 366 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  50.55 
 
 		 350 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  50.48 
 
 		 365 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  50.48 
 
 		 365 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  51.25 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  51.25 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  50.63 
 
 		 364 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  40.38 
 
 		 373 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 366 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 366 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 366 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  43.75 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  43.48 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  41 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 364 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.06 
 
 		 355 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3991  inner-membrane translocator  42.06 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 345 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  34 
 
 		 348 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 388 aa  60.1  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  39.18 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  41.98 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4146  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 344 aa  57.4  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  31 
 
 		 382 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 344 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.86 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 400 aa  55.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 344 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 344 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  34.15 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  34.15 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.78 
 
 		 365 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 365 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  55 
 
 		 365 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  51.85 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 363 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>