More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3991 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3991  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  67.5 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  71.43 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  69.01 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  54.37 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  53.8 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  56.79 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  54.24 
 
 		 349 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  53.8 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  52.81 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  53.44 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  53.44 
 
 		 347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  57.47 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4428  inner-membrane translocator  68.98 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5335  inner-membrane translocator  53.11 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  39.84 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0935  inner-membrane translocator  59.31 
 
 		 352 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  36.97 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  36.41 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  36.69 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  38.1 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 355 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  38.66 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.05 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 364 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 364 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  38.4 
 
 		 371 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  37.03 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  33.81 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 344 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 		 360 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  33.52 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 361 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  29.61 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  32.88 
 
 		 360 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  28.69 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 358 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 442 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  33.15 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  38.27 
 
 		 350 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  33.15 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  35.64 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.52 
 
 		 392 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  35.4 
 
 		 358 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  32.06 
 
 		 369 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  32.32 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  31.92 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>