More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_6806 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_6806  predicted protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2529  pseudouridine synthase, Rsu  41.98 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2035  pseudouridine synthase  39.76 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  40.16 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1106  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1753  RNA-binding S4 domain protein  39.36 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2459  RNA-binding S4 domain protein  41.41 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  hitchhiker  0.000345164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0474  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.65 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.15939 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1558  pseudouridine synthase family protein  40.55 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2024  pseudouridine synthase family protein  40.39 
 
 		 557 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0465  RNA-binding S4 domain protein  37.25 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.117084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1254  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.92 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0063069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1913  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.43 
 
 		 416 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1692  pseudouridine synthase  39.44 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1432  pseudouridine synthase, Rsu  40 
 
 		 610 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648222 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1332  RNA pseudouridine synthase family protein  40.62 
 
 		 559 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2586  pseudouridine synthase family protein  40.62 
 
 		 585 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2060  RNA pseudouridine synthase family protein  40.62 
 
 		 559 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.239559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0263  pseudouridine synthase, Rsu  36.67 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2497  RNA pseudouridine synthase family protein  40.62 
 
 		 571 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3251  RNA pseudouridine synthase family protein  40.62 
 
 		 563 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.9005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2440  RNA pseudouridine synthase family protein  40.62 
 
 		 574 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5332  pseudouridine synthase, Rsu  38.82 
 
 		 623 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0606  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  37.3 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000119564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1678  pseudouridine synthase, Rsu  40.32 
 
 		 649 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151173  normal  0.0771799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1341  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.53 
 
 		 624 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2042  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.82 
 
 		 650 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.483684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1339  RNA-binding S4 domain protein  41.02 
 
 		 627 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.476364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4985  RNA-binding S4 domain protein  35.53 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33907  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6055  pseudouridine synthase, Rsu  38.43 
 
 		 669 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597355  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2022  pseudouridine synthase, Rsu  38.43 
 
 		 669 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1924  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.04 
 
 		 646 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4291  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.86 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0485  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.25 
 
 		 305 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2055  pseudouridine synthase, Rsu  38.04 
 
 		 690 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1884  pseudouridine synthase, Rsu  39.92 
 
 		 694 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1275  RNA-binding S4 domain protein  40.62 
 
 		 674 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1168  pseudouridine synthase  38.34 
 
 		 591 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3468  pseudouridine synthase, Rsu  37.34 
 
 		 379 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.242566  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3595  pseudouridine synthase  37.7 
 
 		 278 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  39.92 
 
 		 631 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3544  RNA-binding S4  35.16 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.824299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1005  RNA-binding S4 domain protein  32.79 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.0262199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2033  putative arginine/proline rich protein  37.45 
 
 		 421 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0619869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.6 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.4 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  34.27 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  37.05 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.14 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2613  RNA pseudouridine synthase family protein  30.45 
 
 		 298 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2299  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  30.45 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2192  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.63 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1235  pseudouridine synthase  31.69 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176862  normal  0.0316242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2974  RNA pseudouridine synthase family protein  28.81 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0675  pseudouridine synthase  34.13 
 
 		 238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1816  pseudouridine synthase family 1 protein  31.97 
 
 		 340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01258  pseudouridylate synthase  31.58 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2221  RNA pseudouridylate synthase  28.4 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2160  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  28.4 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.28876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2144  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2403  RNA pseudouridine synthase family protein  28.4 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2353  RNA pseudouridine synthase family protein  28.4 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2386  RNA pseudouridine synthase family protein  28.4 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2488  RNA pseudouridine synthase family protein  28.4 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  33.88 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6011  pseudouridine synthase  32.53 
 
 		 389 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0603  23S rRNA pseudouridine synthase F  30.61 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.10967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004196  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  30.68 
 
 		 385 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00815873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0618  pseudouridine synthase, Rsu  34.66 
 
 		 372 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0879771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1748  23S rRNA pseudouridine synthase F  30.12 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10768  predicted protein  34.25 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2417  RNA pseudouridylate synthase family protein  27.98 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  32.39 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0855  23S rRNA pseudouridine synthase F  30.61 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1293  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  34.51 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159925  normal  0.17953 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1377  pseudouridine synthase, Rsu  35.22 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1987  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  29.67 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  34.9 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  34.9 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09831  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  33.6 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1204  ribosomal large subunit pseudouridine synthase F  31.02 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.501525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0908  23S rRNA pseudouridine synthase F  30.2 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.500296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2938  23S rRNA pseudouridine synthase F  31.02 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  33.07 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3873  pseudouridine synthase  32.02 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341682 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0987  ribosomal large subunit pseudouridine synthase f  30.45 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12681  pseudouridine synthase, Rsu  32.22 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.850167  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12611  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  32.77 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  33.73 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1151  RNA pseudouridine synthase family protein  30.45 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000576228  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1367  pseudouridine synthase  29.51 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  31.73 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  28.74 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12541  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal small subunit  29.05 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.558344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3815  23S rRNA pseudouridine synthase F  30.61 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  33.72 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0394  pseudouridine synthase  35.56 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.734579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2990  23S rRNA pseudouridine synthase F  29.39 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3069  23S rRNA pseudouridine synthase F  29.39 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  32.67 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>