More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1807 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2171  pseudouridine synthase  57.14 
 
 		 245 aa  287  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4848  RNA pseudouridylate synthase family protein  58.97 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4438  pseudouridylate synthase (ribosomal small subunit pseudouridine synthase A)  58.97 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4958  RNA pseudouridine synthase family protein  58.97 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4841  RNA pseudouridine synthase family protein  58.97 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4456  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  58.97 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4818  RNA pseudouridine synthase family protein  58.55 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3369  pseudouridine synthase  59.4 
 
 		 242 aa  284  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3219  pseudouridine synthase  57.81 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0418  RNA pseudouridine synthase family protein  58.12 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4823  RNA pseudouridine synthase family protein  58.55 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4537  pseudouridine synthase  58.97 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2546  16S pseudouridylate synthase  59.07 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2249  16S pseudouridylate synthase  59.49 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  56.78 
 
 		 243 aa  278  8e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00693564  normal  0.573112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2758  pseudouridine synthase  58.72 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0675  pseudouridine synthase  57.2 
 
 		 248 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4602  RNA pseudouridylate synthase  58.22 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3161  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  60.68 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2588  pseudouridine synthase  51.48 
 
 		 245 aa  255  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2791  pseudouridine synthase  50.42 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2374  pseudouridine synthase  52.99 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1475  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  49.58 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00514925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1466  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  48.31 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000808741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1808  pseudouridine synthase  52.79 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1843  pseudouridine synthase  52.79 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.48228  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1220  pseudouridine synthase  48.47 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0744  pseudouridine synthase  51.07 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2545  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  45.87 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1222  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related pseudouridylate synthase  49.36 
 
 		 245 aa  211  5.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000251934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0801  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A, putative  44.07 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0182974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  46.96 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  47.39 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0096  RNA-binding S4 domain protein  47.92 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0860  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.91 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0736  pseudouridine synthase  42.5 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000262919  decreased coverage  0.00132516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1312  pseudouridine synthase family 1 protein  47.86 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0766504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1696  RNA-binding S4 domain protein  46.67 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1494  pseudouridine synthase  46.58 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0183  pseudouridine synthase  41.95 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0593  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  42.55 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  41.25 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  42.8 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.6 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  39.26 
 
 		 255 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  39.83 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  38.75 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.6 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.83 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1919  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000207089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.34 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  38.91 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1241  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  41.1 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000134561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3602  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0916  pseudouridine synthase  38.63 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.952694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3089  pseudouridine synthase  39.92 
 
 		 266 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000212991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1172  pseudouridine synthase  39.92 
 
 		 266 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8005300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1217  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.32 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000897909  hitchhiker  0.000000206079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3527  pseudouridine synthase  39.15 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0423129  hitchhiker  0.000538559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1820  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.21 
 
 		 288 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  38.43 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0099  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.22 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1466  pseudouridine synthase  40.51 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2704  pseudouridine synthase  37.87 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.960401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2975  pseudouridine synthase  38.82 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0220169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0016  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.14 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.162823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1090  pseudouridine synthase, Rsu  40.52 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000837656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2505  pseudouridine synthase  38.82 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2070  pseudouridine synthase  39.15 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0652133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.15 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1184  pseudouridine synthase  38.21 
 
 		 254 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0542  pseudouridine synthase, Rsu  37.66 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1581  pseudouridine synthase  39.51 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.21 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  40.43 
 
 		 309 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1557  pseudouridine synthase  39.51 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0166  pseudouridine synthase  39.59 
 
 		 556 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5639  pseudouridine synthase  36.97 
 
 		 553 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  38.14 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0497  pseudouridine synthase  38.33 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1010  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.98 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0792  pseudouridine synthase  40.51 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0788  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.34 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0198055  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2237  pseudouridine synthase  36.02 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  40 
 
 		 624 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0996  pseudouridine synthase  40.85 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2728  pseudouridine synthase  37.61 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  35.78 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2614  pseudouridine synthase, Rsu  39.58 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0674  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A protein  34.45 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0779  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  34.87 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1196  pseudouridine synthase  38.14 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  40.25 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  35.37 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0806  pseudouridine synthase  33.61 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316767  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1301  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.55 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2459  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.61 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.8368  hitchhiker  0.0000353867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  35.98 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>