More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS4602 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS4602  RNA pseudouridylate synthase  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4958  RNA pseudouridine synthase family protein  100 
 
 		 242 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4848  RNA pseudouridylate synthase family protein  99.57 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4438  pseudouridylate synthase (ribosomal small subunit pseudouridine synthase A)  99.57 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4841  RNA pseudouridine synthase family protein  99.57 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4456  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  99.14 
 
 		 242 aa  456  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4823  RNA pseudouridine synthase family protein  99.57 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0418  RNA pseudouridine synthase family protein  97.85 
 
 		 242 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4818  RNA pseudouridine synthase family protein  98.28 
 
 		 242 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4537  pseudouridine synthase  94.85 
 
 		 242 aa  440  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3369  pseudouridine synthase  88.36 
 
 		 242 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2758  pseudouridine synthase  69.74 
 
 		 240 aa  329  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0675  pseudouridine synthase  68.1 
 
 		 248 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3219  pseudouridine synthase  62.22 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2171  pseudouridine synthase  58.22 
 
 		 245 aa  275  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  58.22 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3161  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  63.39 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  57.78 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00693564  normal  0.573112 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2546  16S pseudouridylate synthase  55.11 
 
 		 239 aa  254  8e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2249  16S pseudouridylate synthase  54.67 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2588  pseudouridine synthase  50 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2545  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  48.92 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1475  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  48.7 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00514925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0096  RNA-binding S4 domain protein  48.91 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1466  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  46.55 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000808741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0801  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A, putative  46.26 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0182974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1808  pseudouridine synthase  47.56 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1843  pseudouridine synthase  47.56 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.48228  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0744  pseudouridine synthase  46.64 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2374  pseudouridine synthase  49.11 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1222  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related pseudouridylate synthase  48.89 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000251934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2791  pseudouridine synthase  45.81 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1312  pseudouridine synthase family 1 protein  48.23 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0766504  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0593  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  44.49 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000243633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0736  pseudouridine synthase  46.36 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000262919  decreased coverage  0.00132516 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1220  pseudouridine synthase  41.96 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  43.97 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1696  RNA-binding S4 domain protein  45.37 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  43.53 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0860  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.63 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0183  pseudouridine synthase  41.96 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0916  pseudouridine synthase  40.83 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.952694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3602  pseudouridine synthase  40.18 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.23 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2975  pseudouridine synthase  42.04 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0220169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1115  pseudouridine synthase  42.15 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.288715  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1013  pseudouridine synthase  42.15 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.163733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1082  pseudouridine synthase  42.15 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0607342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3276  pseudouridine synthase  42.15 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.471385  normal  0.11353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2704  pseudouridine synthase  40.17 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.960401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2459  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.07 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.8368  hitchhiker  0.0000353867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2614  pseudouridine synthase, Rsu  42.04 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.74 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1494  pseudouridine synthase  41.07 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0792  pseudouridine synthase  41.52 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  39.29 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3176  pseudouridine synthase  42.04 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1241  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.53 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000134561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1626  pseudouridine synthase  36.21 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3175  pseudouridine synthase, Rsu  42.01 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1049  pseudouridine synthase  40.45 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  39.04 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2462  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.16 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2573  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.16 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  hitchhiker  0.00365879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2371  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.16 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000147517  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0478  pseudouridine synthase  39.38 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2416  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.16 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0365053  normal  0.123384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2352  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.01 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1490  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.46 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2779  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.81 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2718  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.46 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00684404  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2793  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.46 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0760  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  42.2 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000225375  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  40 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1019  pseudouridine synthase  40.36 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3252  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.81 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.274461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02113  16S rRNA pseudouridylate 516 synthase  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1474  pseudouridine synthase  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  35.09 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0541  ribosomal small subunit pseudouridine synthase  38.94 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504782  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0340688  normal  0.608364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1464  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00167101  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2481  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0457418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2332  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531797  normal  0.0465983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0788  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  42.47 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0198055  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02072  hypothetical protein  37.44 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0016  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.77 
 
 		 235 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.162823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0775  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.44 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.329505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1090  pseudouridine synthase, Rsu  40.99 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000837656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  36.4 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.03 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3730  pseudouridine synthase  40.36 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0398  pseudouridine synthase  39.21 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1800  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000268682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3178  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  42.47 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.021025  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0843  pseudouridine synthase, Rsu  38.64 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2223  pseudouridine synthase  39.04 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000780288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.77 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  36.73 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>