More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1843 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1843  pseudouridine synthase  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.48228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1808  pseudouridine synthase  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1312  pseudouridine synthase family 1 protein  72.81 
 
 		 230 aa  342  4e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0766504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2758  pseudouridine synthase  51.28 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  49.79 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00693564  normal  0.573112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0675  pseudouridine synthase  49.57 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  52.79 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3219  pseudouridine synthase  49.57 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2791  pseudouridine synthase  48.47 
 
 		 240 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2249  16S pseudouridylate synthase  51.3 
 
 		 239 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2546  16S pseudouridylate synthase  51.3 
 
 		 239 aa  221  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3369  pseudouridine synthase  48.93 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4848  RNA pseudouridylate synthase family protein  48.72 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4438  pseudouridylate synthase (ribosomal small subunit pseudouridine synthase A)  48.72 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4958  RNA pseudouridine synthase family protein  48.93 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4841  RNA pseudouridine synthase family protein  48.72 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4456  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  48.72 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4818  RNA pseudouridine synthase family protein  48.29 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0418  RNA pseudouridine synthase family protein  48.29 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4823  RNA pseudouridine synthase family protein  48.93 
 
 		 242 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2171  pseudouridine synthase  46.55 
 
 		 245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100732  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0744  pseudouridine synthase  49.1 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2374  pseudouridine synthase  50 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4537  pseudouridine synthase  47.86 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  45.85 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1466  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  46.61 
 
 		 243 aa  208  6e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000808741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1475  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  46.81 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00514925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2588  pseudouridine synthase  45.73 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3161  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  48.91 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  45.41 
 
 		 239 aa  204  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4602  RNA pseudouridylate synthase  47.56 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1220  pseudouridine synthase  45.5 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2545  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  44.17 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1222  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related pseudouridylate synthase  48.25 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000251934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0096  RNA-binding S4 domain protein  44.92 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1696  RNA-binding S4 domain protein  44.49 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1494  pseudouridine synthase  42.86 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0736  pseudouridine synthase  41.26 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000262919  decreased coverage  0.00132516 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0801  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A, putative  42.17 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0182974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0916  pseudouridine synthase  37.78 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.952694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1919  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.68 
 
 		 242 aa  167  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000207089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0792  pseudouridine synthase  41.92 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2718  16S rRNA pseudouridylate synthase A  40.09 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00684404  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2793  16S rRNA pseudouridylate synthase A  40.09 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1490  16S rRNA pseudouridylate synthase A  40.81 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1090  pseudouridine synthase, Rsu  39.57 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000837656  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0860  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.91 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0843  pseudouridine synthase, Rsu  41.15 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0704  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  39.15 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0593  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.7 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0183  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0955  pseudouridine synthase, Rsu  37.67 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256039  normal  0.742007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1099  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  37.67 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2614  pseudouridine synthase, Rsu  37.89 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0099  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.57 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  37.39 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1019  pseudouridine synthase  40.97 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  36.17 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0788  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0198055  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3527  pseudouridine synthase  37.39 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0423129  hitchhiker  0.000538559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3176  pseudouridine synthase  38.33 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2352  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.66 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  37.55 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3252  16S rRNA pseudouridylate synthase A  39.47 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3602  pseudouridine synthase  37.22 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0760  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000225375  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1013  pseudouridine synthase  40.54 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.163733  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3178  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.89 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.021025  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2277  pseudouridine synthase  35.9 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0349808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3730  pseudouridine synthase  37.89 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0016  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.48 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.162823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2779  16S rRNA pseudouridylate synthase A  36.8 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2552  pseudouridine synthase  35.86 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1241  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.71 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000134561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3507  pseudouridine synthase  37.66 
 
 		 256 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2975  pseudouridine synthase  38.43 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0220169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3276  pseudouridine synthase  40 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.471385  normal  0.11353 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02113  16S rRNA pseudouridylate 516 synthase  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1474  pseudouridine synthase  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2481  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0457418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1464  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00167101  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02072  hypothetical protein  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0340688  normal  0.608364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2332  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531797  normal  0.0465983 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2237  pseudouridine synthase  33.91 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1082  pseudouridine synthase  40 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0607342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.74 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0775  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.329505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3623  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3555  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114028  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3746  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0687  pseudouridine synthase  38.53 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.302513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0996  pseudouridine synthase  40.81 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1403  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  35.78 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0058  pseudouridine synthase  35.56 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1493  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1527  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  35.19 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2785  pseudouridine synthase, Rsu  40 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>