More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4537 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4537  pseudouridine synthase  100 
 
 		 242 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4818  RNA pseudouridine synthase family protein  95.87 
 
 		 242 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0418  RNA pseudouridine synthase family protein  95.45 
 
 		 242 aa  461  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12702  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4456  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  95.04 
 
 		 242 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4958  RNA pseudouridine synthase family protein  95.04 
 
 		 242 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4848  RNA pseudouridylate synthase family protein  94.63 
 
 		 242 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4438  pseudouridylate synthase (ribosomal small subunit pseudouridine synthase A)  94.63 
 
 		 242 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4841  RNA pseudouridine synthase family protein  94.63 
 
 		 242 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4823  RNA pseudouridine synthase family protein  94.63 
 
 		 242 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4602  RNA pseudouridylate synthase  94.85 
 
 		 233 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3369  pseudouridine synthase  89.63 
 
 		 242 aa  434  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2758  pseudouridine synthase  69.2 
 
 		 240 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0675  pseudouridine synthase  67.22 
 
 		 248 aa  335  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3219  pseudouridine synthase  60.26 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  58.97 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2171  pseudouridine synthase  57.94 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3161  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  63.09 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  58.37 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00693564  normal  0.573112 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2546  16S pseudouridylate synthase  54.94 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2249  16S pseudouridylate synthase  54.51 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2588  pseudouridine synthase  49.17 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2545  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  51.45 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0096  RNA-binding S4 domain protein  50.21 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1475  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  49.37 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00514925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1466  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  46.47 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000808741  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0744  pseudouridine synthase  48.5 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2374  pseudouridine synthase  50.43 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0801  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A, putative  46.41 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0182974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1222  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related pseudouridylate synthase  49.57 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000251934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1808  pseudouridine synthase  47.86 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1843  pseudouridine synthase  47.86 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.48228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1312  pseudouridine synthase family 1 protein  49.36 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0766504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0736  pseudouridine synthase  48.68 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000262919  decreased coverage  0.00132516 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0593  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  45.15 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000243633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2791  pseudouridine synthase  46.19 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1220  pseudouridine synthase  43.78 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1696  RNA-binding S4 domain protein  45.99 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  43.8 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  43.39 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0183  pseudouridine synthase  43.53 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0860  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1494  pseudouridine synthase  42.74 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2704  pseudouridine synthase  41.77 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.960401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2975  pseudouridine synthase  41.53 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0220169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2614  pseudouridine synthase, Rsu  43.04 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3176  pseudouridine synthase  42.37 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3602  pseudouridine synthase  40.52 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2459  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.53 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.8368  hitchhiker  0.0000353867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0916  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.952694 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.75 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1082  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0607342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1013  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.163733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1115  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.288715  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.51 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3276  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.471385  normal  0.11353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2416  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.66 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0365053  normal  0.123384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2371  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.66 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000147517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2573  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.66 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  hitchhiker  0.00365879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2462  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.66 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  39.41 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1335  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1241  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.51 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000134561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0792  pseudouridine synthase  41.35 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3981  pseudouridine synthase, Rsu  36.82 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2779  16S rRNA pseudouridylate synthase A  39.22 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  39.66 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1355  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.79 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.440564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1406  ribosomal large subunit pseudouridine synthaseB (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase)  40.85 
 
 		 239 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  39.91 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0478  pseudouridine synthase  39.15 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02113  16S rRNA pseudouridylate 516 synthase  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1474  pseudouridine synthase  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0340688  normal  0.608364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0775  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.329505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1049  pseudouridine synthase  39.39 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02072  hypothetical protein  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2481  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0457418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2321  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2352  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.03 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1464  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00167101  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2332  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.93 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531797  normal  0.0465983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4247  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  37.87 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.693259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3730  pseudouridine synthase  40.51 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3175  pseudouridine synthase, Rsu  40.95 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.974586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2793  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.46 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2718  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.46 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00684404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0843  pseudouridine synthase, Rsu  38.89 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1639  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.87 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0760  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.68 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000225375  normal  0.539293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1919  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000207089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1490  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.46 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  36.55 
 
 		 253 aa  151  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0541  ribosomal small subunit pseudouridine synthase  38.72 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3252  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.36 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0309  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003781  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  39.32 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000946261  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0788  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  41.35 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0198055  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1090  pseudouridine synthase, Rsu  40 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000837656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2095  pseudouridine synthase  36.29 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3527  pseudouridine synthase  35.17 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0423129  hitchhiker  0.000538559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>