More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2758 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2758  pseudouridine synthase  100 
 
 		 240 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0675  pseudouridine synthase  84.17 
 
 		 248 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4958  RNA pseudouridine synthase family protein  69.62 
 
 		 242 aa  344  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4841  RNA pseudouridine synthase family protein  69.62 
 
 		 242 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4848  RNA pseudouridylate synthase family protein  69.62 
 
 		 242 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4438  pseudouridylate synthase (ribosomal small subunit pseudouridine synthase A)  69.62 
 
 		 242 aa  344  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4456  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  69.62 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4823  RNA pseudouridine synthase family protein  69.2 
 
 		 242 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3369  pseudouridine synthase  70.46 
 
 		 242 aa  341  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4818  RNA pseudouridine synthase family protein  69.62 
 
 		 242 aa  341  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0418  RNA pseudouridine synthase family protein  69.2 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4537  pseudouridine synthase  69.2 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4602  RNA pseudouridylate synthase  69.74 
 
 		 233 aa  329  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3219  pseudouridine synthase  59.92 
 
 		 249 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  60.43 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00693564  normal  0.573112 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3161  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  64.1 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1807  pseudouridine synthase  58.72 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2171  pseudouridine synthase  54.27 
 
 		 245 aa  275  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2249  16S pseudouridylate synthase  57.08 
 
 		 239 aa  269  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2546  16S pseudouridylate synthase  56.65 
 
 		 239 aa  268  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2588  pseudouridine synthase  54.24 
 
 		 245 aa  265  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2545  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  52.89 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1808  pseudouridine synthase  51.28 
 
 		 231 aa  235  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1843  pseudouridine synthase  51.28 
 
 		 231 aa  235  6e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.48228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2791  pseudouridine synthase  51.9 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0096  RNA-binding S4 domain protein  48.12 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1466  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  48.54 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000808741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1222  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related pseudouridylate synthase  49.57 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000251934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0744  pseudouridine synthase  46.35 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1312  pseudouridine synthase family 1 protein  50.64 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0766504  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0801  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A, putative  45.99 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0182974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2374  pseudouridine synthase  50.63 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1475  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  47.28 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00514925  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0593  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  43.88 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000243633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1696  RNA-binding S4 domain protein  45.19 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1220  pseudouridine synthase  42.92 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0736  pseudouridine synthase  46.58 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000262919  decreased coverage  0.00132516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0860  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0660  pseudouridine synthase  43.72 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1494  pseudouridine synthase  44.87 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0684  pseudouridine synthase  43.29 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0183  pseudouridine synthase  42.31 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000206046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1292  pseudouridine synthase  45.38 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1743  pseudouridine synthase  42.44 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3602  pseudouridine synthase  42.06 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09640  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.98 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.444703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0757  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.6 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000912353  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2704  pseudouridine synthase  41.18 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.960401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1241  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  44.02 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000134561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0888  16S rRNA uridine-516 pseudouridylate synthase related enzyme  40.5 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000206154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1626  pseudouridine synthase  38.17 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0689  pseudouridine synthase  37.55 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1578  pseudouridine synthase  41.25 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1593  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  40.34 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1082  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0607342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1090  pseudouridine synthase, Rsu  41.28 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000837656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1142  pseudouridine synthase  42.26 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3276  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.471385  normal  0.11353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5061  pseudouridine synthase  41.1 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0210858  normal  0.0392738 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1013  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.163733  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1211  pseudouridine synthase  37.13 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1115  pseudouridine synthase  40.68 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.288715  hitchhiker  0.0098701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0916  pseudouridine synthase  38.53 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.952694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2459  16S rRNA pseudouridylate synthase A  38.36 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.8368  hitchhiker  0.0000353867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2785  pseudouridine synthase, Rsu  39.33 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2744  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  37.71 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3252  16S rRNA pseudouridylate synthase A  39.22 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2237  pseudouridine synthase  36.71 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3411  pseudouridine synthase  37.5 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1056  pseudouridine synthase RluB  38.75 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0016  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.3 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.162823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1335  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  40.17 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2352  16S rRNA pseudouridylate synthase A  39.32 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06820  pseudouridine synthase family protein  36.6 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.493821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3042  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  36.44 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.412823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2614  pseudouridine synthase, Rsu  40.83 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2779  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.66 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2371  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000147517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0693  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  41.28 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3981  pseudouridine synthase, Rsu  38.03 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1401  pseudouridine synthase  36.67 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2462  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2416  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0365053  normal  0.123384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2573  16S rRNA pseudouridylate synthase A  37.5 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  hitchhiker  0.00365879 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1196  pseudouridine synthase  39.08 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.939109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1550  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1019  pseudouridine synthase  39.83 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0017  pseudouridine synthase  35.74 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1581  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  38.75 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3469  pseudouridine synthase, Rsu  39.22 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2975  pseudouridine synthase  38.91 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0220169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1236  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  39.83 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.862824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3120  pseudouridine synthase  42.92 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.246679  hitchhiker  0.00195827 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0369  pseudouridine synthase  36.51 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1490  16S rRNA pseudouridylate synthase A  39.74 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2718  16S rRNA pseudouridylate synthase A  39.74 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00684404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0477  pseudouridine synthase  40.34 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2793  16S rRNA pseudouridylate synthase A  39.74 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4247  ribosomal small subunit pseudouridine synthase A  38.03 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.693259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1730  pseudouridine synthase  39.17 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>