More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1618 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1618  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 543 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1069 aa  89  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1276 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 927 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.34 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.03 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.05 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 614 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.56 
 
 		 626 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 614 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.59 
 
 		 1694 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 626 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 614 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 614 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 		 614 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.8 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1121 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 4489 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.5 
 
 		 1007 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 3560 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 523 aa  72  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 3035 aa  72  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1138 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 4079 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.57 
 
 		 784 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 836 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 740 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 639 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  28.77 
 
 		 539 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2066  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.39 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.585101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.41 
 
 		 1979 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.47 
 
 		 715 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.75 
 
 		 560 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 523 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  29.86 
 
 		 706 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 612 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.02 
 
 		 1056 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 804 aa  65.5  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 512 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  29.41 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.69 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.86 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.52 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.19 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.43 
 
 		 988 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.55 
 
 		 936 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 		 818 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1022 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  24.42 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 635 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  30.07 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 635 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 		 1056 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 637 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.53 
 
 		 810 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  29.47 
 
 		 1056 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  26 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 617 aa  62.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26.67 
 
 		 623 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 467 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 878 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 620 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.1 
 
 		 573 aa  62.4  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 450 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  32.17 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.41 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.56 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.59 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.41 
 
 		 1106 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  28.87 
 
 		 582 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 827 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>