More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2400 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2400  tRNA pseudouridine synthase ACD  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  47.08 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2714  tRNA pseudouridine synthase ACD  48.21 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.971768  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1675  tRNA pseudouridine synthase ACD  45.45 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.352236  hitchhiker  0.000000344781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2301  tRNA pseudouridine synthase ACD  46.58 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1332  tRNA pseudouridine synthase A  41 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1625  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.875957  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0989  tRNA pseudouridine synthase A  35.6 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  36.82 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.48 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  35.66 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.88 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  34 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.96 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.69 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  33.86 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  32.8 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32.8 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.33 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  34.17 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  34.41 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.93 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0964  tRNA pseudouridine synthase A  35.95 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  32.27 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  32.27 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4476  tRNA pseudouridine synthase A  34.8 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  34.02 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.28 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  30.65 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  32.52 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2207  tRNA pseudouridine synthase A  31.1 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  33.75 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4288  tRNA pseudouridine synthase A  31.37 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.620065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1318  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620089  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  33.86 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  33.46 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2159  tRNA pseudouridine synthase A  34.8 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0844535 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  31.67 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  34.26 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1523  tRNA pseudouridine synthase A  32.5 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000575068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  31.93 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  32.08 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  32.08 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  31.13 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0389  tRNA pseudouridine synthase A  31.37 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_3550  predicted protein  32.05 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.658668  normal  0.123693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3109  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  31.67 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28572  predicted protein  32.81 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0301527  hitchhiker  0.000000212396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1217  tRNA pseudouridine synthase A  31.6 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1219  tRNA pseudouridine synthase A  31.42 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1129  tRNA pseudouridine synthase A  30.23 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1174  tRNA pseudouridine synthase A  32.72 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.329599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  30.96 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0248  tRNA pseudouridine synthase A  33.88 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  31.8 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3462  tRNA pseudouridine synthase A  34.24 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0627  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.801846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0411  tRNA pseudouridine synthase A  34.78 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  33.05 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1525  Pseudouridine synthase I, TruA, alpha/beta domain protein  31.9 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0595  tRNA pseudouridine synthase A  29.86 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  31.94 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  31.28 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  30.25 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  31.94 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5154  tRNA pseudouridine synthase A  31.35 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6020  tRNA pseudouridine synthase A  34.41 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0748411  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  32.16 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1417  tRNA pseudouridine synthase A  33.76 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  31.05 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  32.3 
 
 		 275 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  30.33 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>