288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0852 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 302 aa  607  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  64.48 
 
 		 300 aa  344  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  49.31 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  47.16 
 
 		 296 aa  263  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  48.94 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  49.11 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  48.23 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  44.48 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  43.57 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  41.61 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  43.43 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  40.35 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  42.91 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  42.75 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  42.35 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  40.98 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  26.62 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  25.67 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  24.46 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  26.17 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  24.1 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  24.1 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  26.3 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  26.3 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  26.3 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  26.3 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  25.83 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  24.54 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  26.39 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  25.69 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  26.04 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  26.04 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  30.09 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  29.41 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  27.02 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  25.69 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  25.65 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  26.21 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.53 
 
 		 785 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  25.69 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.53 
 
 		 785 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  25 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  21.11 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.98 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  21.69 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  23.4 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.07 
 
 		 759 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  28.25 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  25.37 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  25.37 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  27.34 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  29.17 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  23.99 
 
 		 735 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  22.8 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  22.8 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  24.83 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  23.53 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  25.52 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.98 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.09 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  25 
 
 		 761 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  27.27 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  24.91 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  25.91 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.09 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.59 
 
 		 762 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.09 
 
 		 834 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  23.58 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  27.47 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  22.68 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  27.47 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  24.91 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  27.47 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  25.95 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  24.5 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  28.81 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  24.5 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  26.67 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  27.98 
 
 		 357 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  23.7 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  27.24 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5118  preprotein translocase subunit SecF  25.84 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  22.93 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  22.95 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  24.86 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  23 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  27.31 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  25.39 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  26.74 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  26.03 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  22.69 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  26.03 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  25.85 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>