More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1963 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 293 aa  579  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  57.38 
 
 		 298 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  53.23 
 
 		 302 aa  308  5e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  55.81 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  54.42 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  38.52 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  40.65 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  43.21 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  35.66 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  35.13 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  32.84 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  36.76 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  43.35 
 
 		 281 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  21.71 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  22.88 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.68 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  22.42 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  22.02 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  25.68 
 
 		 759 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.26 
 
 		 759 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.5 
 
 		 785 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.5 
 
 		 785 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  28.46 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.61 
 
 		 750 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  23.14 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.74 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.74 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  22.11 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.44 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  27.08 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  23.33 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  27.17 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  24.31 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  26.67 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  26.15 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  18.79 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  18.43 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  25.99 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  18.43 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.78 
 
 		 846 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  25.42 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  22.93 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.66 
 
 		 755 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  27.4 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  26.8 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  24.47 
 
 		 900 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.82 
 
 		 762 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.1 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.74 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.1 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  23.85 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.1 
 
 		 754 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  21.69 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.21 
 
 		 911 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  20.69 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  26.15 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.75 
 
 		 752 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.74 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.74 
 
 		 754 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  19.92 
 
 		 855 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.1 
 
 		 754 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  26.03 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  26.03 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.1 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  26.96 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  26.78 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.1 
 
 		 754 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  23.57 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.4 
 
 		 990 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  21.84 
 
 		 977 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  24.73 
 
 		 406 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  22.87 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  25.6 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  29.32 
 
 		 748 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  25.12 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  21.36 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  24.8 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  22.61 
 
 		 372 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.15 
 
 		 856 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  20.85 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  22.46 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  20.99 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>