188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0772 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  97.15 
 
 		 281 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  96.8 
 
 		 281 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  81.85 
 
 		 291 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  61.21 
 
 		 280 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  41.91 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  42.97 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  39 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  37.24 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  33.8 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  35.35 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  47.65 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  35.06 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  44 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  31.67 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  27.34 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  25.68 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  25.97 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  26.64 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  24.34 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  27.41 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  27.41 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  27.41 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  27.41 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.41 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  24.72 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  23.35 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  25.37 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  27.03 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.65 
 
 		 762 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  28.03 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  28.24 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  28.28 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  27.59 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  25.64 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  24.91 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  25.11 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  25.19 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  25.82 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  24.52 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  26.42 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  27.23 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  25.95 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  23.92 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  24.68 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  22 
 
 		 761 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  27.23 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  25.28 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  25.19 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  25.19 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  27.27 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.18 
 
 		 834 aa  54.3  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  26.1 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  28.17 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  28.17 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  25.52 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  21.57 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  23.05 
 
 		 759 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  27.1 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.36 
 
 		 755 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  27.23 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  23.81 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  24.38 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  24.36 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.43 
 
 		 750 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  25.21 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  23.37 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  27.7 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  24.69 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  25.65 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.76 
 
 		 839 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  26.44 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  30.83 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  26.42 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.1 
 
 		 844 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  27.35 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  24.78 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  27.08 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  25.51 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  22.06 
 
 		 366 aa  49.7  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  25.42 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  26.59 
 
 		 389 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  27.46 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  23.97 
 
 		 358 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  27.24 
 
 		 327 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.43 
 
 		 849 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  25.1 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  23.81 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  23.25 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.15 
 
 		 848 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  23.81 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  23.81 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.92 
 
 		 844 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  23.81 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>