158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3177 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  59.15 
 
 		 284 aa  360  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  56.99 
 
 		 287 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  59.51 
 
 		 284 aa  331  8e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  54.29 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  49.1 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  49.82 
 
 		 302 aa  228  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  38.98 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  36.18 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  40.62 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  41.3 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  45.18 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  35.46 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  38.55 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  23.27 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  28.65 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.21 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  25.89 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  21.81 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  26.92 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  21.31 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  27.47 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  25.73 
 
 		 761 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  25.75 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  25.75 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  24.31 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  25.75 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  25.22 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  24.88 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  24.88 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  24.88 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  24.88 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  25.12 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  24.88 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  37.63 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.89 
 
 		 785 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.89 
 
 		 785 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  24.72 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  24.43 
 
 		 402 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  24.04 
 
 		 402 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  24.43 
 
 		 402 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0095  preprotein translocase subunit SecF  26.04 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  29.03 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0058  preprotein translocase subunit SecF  25.52 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  22.59 
 
 		 323 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  25.93 
 
 		 740 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  19.86 
 
 		 759 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  26.32 
 
 		 320 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 843 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  22.11 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  33.33 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  26.29 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  22.48 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  22.11 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.79 
 
 		 759 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  24.68 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  26.02 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  24 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  24.16 
 
 		 400 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  24.53 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  23.94 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  24.02 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  22.99 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  24.45 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.36 
 
 		 750 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  27.21 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  24.73 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  25.13 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  26.02 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  25.54 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  24.71 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  25.26 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  21.21 
 
 		 1128 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  25.45 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  26.24 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  20.68 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  23.56 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  23.56 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  29.41 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  23.49 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1278  preprotein translocase subunit SecF  23.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.630686  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  23.91 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  23.86 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>