More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2539 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  96.27 
 
 		 402 aa  717    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 402 aa  808    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  97.51 
 
 		 402 aa  719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  75.07 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  36.66 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2397  protein-export membrane protein SecF  31.29 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  0.614956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  37.84 
 
 		 307 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  35.6 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  32.8 
 
 		 327 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.28 
 
 		 759 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  37.21 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1819  preprotein translocase subunit SecF  32.98 
 
 		 356 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814771  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  36.5 
 
 		 337 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  36.5 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.64 
 
 		 762 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  39.59 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 		 307 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  39.23 
 
 		 312 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.77 
 
 		 304 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  35.77 
 
 		 304 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 347 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  30.67 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  35.16 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  35.16 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  41.13 
 
 		 318 aa  167  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  40.16 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  37.26 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.95 
 
 		 845 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0278  preprotein translocase subunit SecF  31.5 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182784  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  36.33 
 
 		 286 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  42.71 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  34.96 
 
 		 302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.39 
 
 		 856 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  34.96 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.2 
 
 		 844 aa  162  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  37.3 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  42.05 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  37.27 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.37 
 
 		 846 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  40.89 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  42.63 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.37 
 
 		 849 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  30.15 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  33.46 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  31.72 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  33.54 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  41.5 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.6 
 
 		 844 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  35.08 
 
 		 311 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  30.31 
 
 		 315 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  36.82 
 
 		 304 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  37.91 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  38.39 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 324 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44 
 
 		 856 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0345  preprotein translocase subunit SecF  29.17 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.63 
 
 		 848 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 324 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.99 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1342  preprotein translocase subunit SecF  32.53 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507667  normal  0.548062 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  32.25 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  30.83 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  35.69 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  29.79 
 
 		 314 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  33.91 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  33.57 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  28.96 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  33.7 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  31.59 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  31.03 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 989 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.69 
 
 		 853 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  29.79 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  40.2 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  38.86 
 
 		 303 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  42.23 
 
 		 315 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  33.5 
 
 		 352 aa  153  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  35.91 
 
 		 315 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  34.31 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  41.62 
 
 		 324 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  38 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  33.7 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  34.25 
 
 		 301 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  35.96 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  36.73 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.2 
 
 		 735 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  39.6 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.93 
 
 		 844 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  34.98 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  37.96 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  36.55 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  44.94 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  36.55 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  36.55 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  37.07 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  40.7 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  27.06 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>