More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0095 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0095  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0058  preprotein translocase subunit SecF  84.98 
 
 
293 aa  490  9.999999999999999e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  49.82 
 
 
291 aa  265  5e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  41.52 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  40.56 
 
 
316 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  40.56 
 
 
320 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  37.76 
 
 
369 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 
367 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  39.51 
 
 
307 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 
323 aa  199  5e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 
323 aa  198  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 
323 aa  198  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  38.79 
 
 
304 aa  195  7e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  36.71 
 
 
335 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  38.79 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  39.79 
 
 
323 aa  195  9e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  41.64 
 
 
312 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  40.56 
 
 
315 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  35.66 
 
 
334 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 
352 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  35.89 
 
 
322 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 
340 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  35.79 
 
 
318 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  40.5 
 
 
323 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  38.19 
 
 
311 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 
328 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.36 
 
 
785 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  38.71 
 
 
313 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.36 
 
 
785 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  38.54 
 
 
315 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 
313 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  36.92 
 
 
315 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  39.07 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.16 
 
 
856 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  37.06 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  35.61 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  35.19 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  36.52 
 
 
315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  35 
 
 
337 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  33.57 
 
 
357 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  39.08 
 
 
324 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  39.08 
 
 
324 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  38.03 
 
 
324 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.3 
 
 
759 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  35 
 
 
316 aa  183  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  36.46 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  36.69 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.86 
 
 
848 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.86 
 
 
849 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  36.96 
 
 
306 aa  181  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  37.72 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  37.72 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.16 
 
 
856 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  37.28 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3571  protein-export membrane protein SecF  36.63 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00137282  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0980  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 
307 aa  178  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00161117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  34.42 
 
 
316 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.69 
 
 
846 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  37.94 
 
 
315 aa  178  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  35.38 
 
 
322 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.69 
 
 
839 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  37.72 
 
 
302 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3399  protein-export membrane protein SecF  37.91 
 
 
308 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  decreased coverage  0.000027343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  36.82 
 
 
315 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.29 
 
 
853 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3249  preprotein translocase subunit SecF  35.97 
 
 
300 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1118  preprotein translocase subunit SecF  35.97 
 
 
300 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.377111  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3291  preprotein translocase subunit SecF  35.97 
 
 
300 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3427  preprotein translocase subunit SecF  35.97 
 
 
300 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000133978  decreased coverage  0.000105765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.46 
 
 
844 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  36.52 
 
 
843 aa  175  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  32.51 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  35.48 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  32.51 
 
 
322 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1194  preprotein translocase subunit SecF  37.14 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  32.51 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  34.83 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  31.9 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  33.92 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  36.46 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
323 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  36.82 
 
 
324 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.56 
 
 
844 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  32.16 
 
 
324 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.56 
 
 
845 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1016  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0271563  hitchhiker  0.00537871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1081  preprotein translocase subunit SecF  37.05 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121562  normal  0.1541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1020  preprotein translocase subunit SecF  36.69 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00412183  hitchhiker  0.000205706 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.41 
 
 
834 aa  172  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  38.43 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  34.17 
 
 
323 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  34.17 
 
 
323 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  34.17 
 
 
323 aa  171  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  34.17 
 
 
323 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  34.17 
 
 
323 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  34.17 
 
 
323 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>