211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1022 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  60.22 
 
 		 284 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  61.15 
 
 		 284 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  56.99 
 
 		 292 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  55.36 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  51.11 
 
 		 302 aa  241  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  48.03 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  40.77 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  41.81 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  40.55 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  43.7 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  40.7 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  41.77 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  35.48 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  36.33 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  36.99 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  43.43 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  25.38 
 
 		 849 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  29.6 
 
 		 740 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  29.56 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.51 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  25.79 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.77 
 
 		 762 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  24.81 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  27.62 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  22.31 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  28.25 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  27.81 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  27.27 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.56 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  26.88 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  23.11 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  27.47 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.71 
 
 		 1226 aa  56.6  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  23.47 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  26.37 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  27.17 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.71 
 
 		 785 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  27.85 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  27.17 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  27.17 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.15 
 
 		 759 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.71 
 
 		 785 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.15 
 
 		 759 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  27.1 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.57 
 
 		 750 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 754 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 754 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  29.02 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  25.87 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  25.17 
 
 		 989 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.32 
 
 		 755 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  25.78 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  24.92 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 759 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.32 
 
 		 754 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  23.77 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  24.06 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  22.34 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  30.65 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  24.89 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  26.96 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  22.27 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  26.34 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.93 
 
 		 844 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  25.08 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2397  protein-export membrane protein SecF  28.57 
 
 		 433 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal  0.614956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  26.7 
 
 		 432 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  24.88 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  23.98 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  29.41 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  26.97 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  27.89 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  25.7 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  26.97 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  23.08 
 
 		 315 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  23.98 
 
 		 346 aa  49.3  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.24 
 
 		 763 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  22.91 
 
 		 735 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  22.71 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  21.88 
 
 		 327 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  21.95 
 
 		 412 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  24.03 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  25 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  29.35 
 
 		 558 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>