231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0896 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  48.23 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  47.16 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  39.86 
 
 		 292 aa  208  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  44.72 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  40.42 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  38.46 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  35.13 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  34.86 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  38.28 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  39 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  38.61 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  38.85 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  33.72 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  42.5 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  26.45 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  24.31 
 
 		 759 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  24.69 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  24.69 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  24.69 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  26.73 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  27.59 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  24.28 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  26.27 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  23.87 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  23.87 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1792  preprotein translocase subunit SecF  27.41 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  25.96 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  22.18 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  26.61 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  25.12 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  25.63 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  22.18 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  22.18 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  23.46 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  22.18 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  22.45 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  24.28 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  24.28 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  26.62 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  26.2 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  27.57 
 
 		 740 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  23.6 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  27.47 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  26.12 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.72 
 
 		 762 aa  59.3  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  25.74 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  24.28 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  25.79 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  25.36 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.49 
 
 		 785 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.49 
 
 		 785 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  25.31 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  25.23 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  21.77 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  23.97 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  23.4 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  25.91 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  26.14 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  23.49 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  24.48 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  26.47 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  24.77 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  24.08 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  23.19 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  23.57 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  28.71 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  27.75 
 
 		 402 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  21.59 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  22.45 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  23.71 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  24.4 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  24.3 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.51 
 
 		 846 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  24.27 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.49 
 
 		 759 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  23.83 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.44 
 
 		 846 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  23.72 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  26.58 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  23.87 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>