218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1655 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  58.8 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  61.15 
 
 		 287 aa  355  5e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  59.51 
 
 		 292 aa  347  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  57.54 
 
 		 301 aa  322  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  47.37 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  48.23 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  44.72 
 
 		 296 aa  221  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  41.81 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  39.18 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  40.78 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  38.68 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  39.76 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  39.44 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  49.42 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  35.19 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  46.82 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  29.05 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  28.09 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.05 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  27.57 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  30.14 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  24.25 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0095  preprotein translocase subunit SecF  28.11 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0058  preprotein translocase subunit SecF  27.36 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  21.83 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  22 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  26.02 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  25.19 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  25.54 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09531  preprotein translocase subunit SecF  23.72 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.14982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  28.84 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  27.65 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  26.05 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.86 
 
 		 1226 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  26.37 
 
 		 404 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  27.8 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  23.88 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  25.56 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  26.39 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  28.02 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  25.09 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  28.93 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  25.89 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.91 
 
 		 759 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  26.84 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  25.12 
 
 		 849 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  23.05 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.43 
 
 		 785 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.43 
 
 		 785 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  26.06 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  25.7 
 
 		 305 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  22.57 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  25.7 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  25.14 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  26.44 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  28.68 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  26.05 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  25.19 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  26.14 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  24.55 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  25.64 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  26.7 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  28.68 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  24.24 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.48 
 
 		 856 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  27.17 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  26.98 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  24.4 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  24.34 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  24.71 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  25.53 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  30.36 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  25.54 
 
 		 360 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  25.52 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09321  preprotein translocase subunit SecF  21.84 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  26.1 
 
 		 315 aa  49.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  26.27 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  23.32 
 
 		 322 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.91 
 
 		 762 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2498  protein-export membrane protein SecF  26.34 
 
 		 301 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  24.77 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  24.87 
 
 		 320 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  24.2 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  25.48 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  26.15 
 
 		 761 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>