250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1796 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  59.15 
 
 		 292 aa  360  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  60.22 
 
 		 287 aa  357  9e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  58.8 
 
 		 284 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  52.5 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  48.94 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  46.59 
 
 		 300 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  38.52 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  38.73 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  39.15 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  38.8 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  37.89 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  41.43 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  40.4 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  38.8 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  29.41 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  28.88 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  27.22 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  23.94 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  27.49 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  27.52 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  27.43 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  26.67 
 
 		 759 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  29.61 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  27.45 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.6 
 
 		 762 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  25.39 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.59 
 
 		 763 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  26.92 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  25.37 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  26.64 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.74 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  27.4 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.74 
 
 		 759 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.53 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  23.83 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1324  protein-export membrane protein SecF  25.83 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0920366  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1310  protein-export membrane protein SecF  30.34 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.66 
 
 		 754 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  23.99 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  22.67 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  26.97 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  26.78 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  26.78 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  26.78 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  26.78 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  26.78 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  26.46 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  26.79 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  27.36 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  28.43 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  25.86 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.22 
 
 		 754 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1411  protein-export membrane protein SecF  29.66 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  26.5 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  25.12 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  20.34 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  25.31 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0235  preprotein translocase subunit SecF  22.13 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.460175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  22.92 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  24.31 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  26 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2539  protein translocase subunit secF  28.77 
 
 		 402 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0110788  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  23.83 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  23.98 
 
 		 735 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  27.48 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  24.58 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 754 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  26.23 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0283  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.164559  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  22.57 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  26.7 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  26.23 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  27.46 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  27.04 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  26.7 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.77 
 
 		 755 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  23.65 
 
 		 849 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.21 
 
 		 752 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  27.55 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  24.88 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  24.53 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  24.64 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>