199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2688 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2688  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1321  preprotein translocase subunit SecF  60.66 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2708  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  59.86 
 
 		 298 aa  338  5e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1963  preprotein translocase subunit SecF  54.42 
 
 		 293 aa  321  9.000000000000001e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.216648  normal  0.175642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0745  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  58.5 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3177  preprotein translocase subunit SecF  39.44 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1796  preprotein translocase subunit SecF  39.43 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.195427  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1022  preprotein translocase subunit SecF  40.65 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0852  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0279  preprotein translocase subunit SecF  36.1 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1655  preprotein translocase subunit SecF  38.68 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.198894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1986  preprotein translocase subunit SecF  40.43 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000216285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0896  preprotein translocase subunit SecF  35.02 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.510447  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1016  preprotein translocase subunit SecF  32.84 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.161719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1146  preprotein translocase subunit SecF  35.69 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0051  preprotein translocase subunit SecF  34.9 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0772  preprotein translocase subunit SecF  44.3 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0837  preprotein translocase subunit SecF  43.42 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  26.58 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  22.79 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  25.65 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  28.81 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.04 
 
 		 853 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  25.32 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  26.99 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.96 
 
 		 849 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  23.81 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  30.8 
 
 		 364 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  24.61 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.71 
 
 		 848 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  25.1 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  28.07 
 
 		 638 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  21.71 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  22.22 
 
 		 750 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  24.6 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  21.71 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  21.71 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  22.73 
 
 		 532 aa  52.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  23 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  21.84 
 
 		 849 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  23.35 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  27.51 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0940  preprotein translocase subunit SecF  25.21 
 
 		 398 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.494806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  23.9 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  26.36 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  24.74 
 
 		 759 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  25 
 
 		 340 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  23.84 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  23.69 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  21.97 
 
 		 620 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  25 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  21.89 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  23.72 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.91 
 
 		 762 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  24.29 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  26.25 
 
 		 621 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  27.69 
 
 		 558 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  27.27 
 
 		 486 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  25.48 
 
 		 618 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  26.63 
 
 		 485 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1617  preprotein translocase subunit SecD  26.57 
 
 		 618 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00434823  normal  0.598494 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.36 
 
 		 839 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  22.22 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  25.15 
 
 		 619 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  23.23 
 
 		 526 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  24.22 
 
 		 735 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  24.47 
 
 		 594 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  21.07 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  20.39 
 
 		 856 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  24.47 
 
 		 594 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  22.14 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  25 
 
 		 627 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  23.11 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.38 
 
 		 607 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  24.22 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  24.09 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  23.48 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  23.88 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  24.77 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  22.52 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  22.86 
 
 		 623 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  24.47 
 
 		 621 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  23.48 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  23.48 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>