More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0026 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  60.35 
 
 		 594 aa  753    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  59.24 
 
 		 605 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  69.43 
 
 		 595 aa  859    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 638 aa  1283    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  74.01 
 
 		 624 aa  929    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  72.5 
 
 		 619 aa  918    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  70.79 
 
 		 607 aa  897    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  46.31 
 
 		 622 aa  526  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.82 
 
 		 995 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.46 
 
 		 990 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.5 
 
 		 991 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  36.74 
 
 		 1029 aa  357  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.56 
 
 		 996 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.6 
 
 		 981 aa  349  9e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  37.63 
 
 		 1001 aa  330  6e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.75 
 
 		 995 aa  323  6e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.07 
 
 		 1055 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  34.37 
 
 		 611 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  33.69 
 
 		 613 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  33.08 
 
 		 613 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  32.92 
 
 		 613 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  48.74 
 
 		 533 aa  290  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  49.69 
 
 		 531 aa  290  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.71 
 
 		 991 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  47.58 
 
 		 525 aa  286  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  48.73 
 
 		 524 aa  282  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  46.67 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  34.1 
 
 		 637 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  47 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  46.56 
 
 		 532 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  49.19 
 
 		 530 aa  273  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  52.19 
 
 		 521 aa  272  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  49.54 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.56 
 
 		 473 aa  272  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  44.7 
 
 		 530 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  48.49 
 
 		 521 aa  269  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  46 
 
 		 532 aa  269  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  49.66 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  44.33 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  50.54 
 
 		 510 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  45.33 
 
 		 532 aa  266  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  48.69 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  47.78 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  49.64 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  47.84 
 
 		 532 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  46.1 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  47.63 
 
 		 526 aa  257  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  45.48 
 
 		 533 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  45.33 
 
 		 533 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  43.55 
 
 		 530 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  45.15 
 
 		 532 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  44 
 
 		 614 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  49.25 
 
 		 554 aa  251  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  43.77 
 
 		 534 aa  250  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  45.42 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  43.67 
 
 		 594 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  42.17 
 
 		 535 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  43.67 
 
 		 594 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  45.94 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  45.55 
 
 		 554 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  45.45 
 
 		 522 aa  246  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  44.29 
 
 		 625 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  42.72 
 
 		 503 aa  246  9.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  44.83 
 
 		 632 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  45.85 
 
 		 531 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  46.62 
 
 		 535 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  48 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  48 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  48 
 
 		 526 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.19 
 
 		 853 aa  243  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  41.45 
 
 		 512 aa  242  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  44.48 
 
 		 632 aa  242  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  44.41 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  43.56 
 
 		 632 aa  240  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  44.44 
 
 		 554 aa  240  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  46.47 
 
 		 554 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  46.47 
 
 		 554 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  47.01 
 
 		 554 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  45.52 
 
 		 533 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  43.69 
 
 		 537 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  46.12 
 
 		 413 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  42.9 
 
 		 599 aa  233  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  45.15 
 
 		 843 aa  233  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  44.7 
 
 		 623 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  44.28 
 
 		 501 aa  231  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  42.39 
 
 		 461 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  44.13 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  41.61 
 
 		 535 aa  230  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.78 
 
 		 856 aa  230  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  43.62 
 
 		 399 aa  230  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  41.78 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  45.35 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  45.26 
 
 		 621 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  45.12 
 
 		 622 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  41.39 
 
 		 535 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  45.17 
 
 		 406 aa  227  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  43.89 
 
 		 620 aa  226  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  43.27 
 
 		 587 aa  226  9e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  43.1 
 
 		 640 aa  226  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  44.57 
 
 		 532 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>