More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1797 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 486 aa  984    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  67.36 
 
 		 507 aa  653    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  58.44 
 
 		 484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  55.62 
 
 		 485 aa  535  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  56.16 
 
 		 497 aa  495  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  37.48 
 
 		 558 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  44.95 
 
 		 566 aa  335  9e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  44.5 
 
 		 564 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  34.69 
 
 		 529 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  29.68 
 
 		 537 aa  207  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  30.46 
 
 		 510 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  35.47 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  30.13 
 
 		 549 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  35.2 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  35.54 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  33.51 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  35.01 
 
 		 388 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  29.03 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  26.39 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  26.55 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  25.16 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  26.38 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  26.58 
 
 		 474 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  25.09 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  25.19 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  25.19 
 
 		 533 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  26.59 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  25.05 
 
 		 533 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  24.3 
 
 		 472 aa  90.5  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  25.7 
 
 		 533 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  25.19 
 
 		 470 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  24.77 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  26.65 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  25.09 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  24.77 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  26.42 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  26.42 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  23.62 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  23.8 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  28.97 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  23.5 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  23.5 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  24.91 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  25.66 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.4 
 
 		 755 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  25.75 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  25.2 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  25.55 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  25.55 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.91 
 
 		 754 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  25.91 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  28.69 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.91 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.91 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  24.91 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.91 
 
 		 754 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.63 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.63 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.63 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.63 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.63 
 
 		 754 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  24.93 
 
 		 735 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  25.91 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  28.11 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  22.02 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  24.07 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.32 
 
 		 752 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  28.03 
 
 		 638 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  27.78 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  25.34 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.12 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  29.03 
 
 		 533 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  26.39 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  28.27 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.32 
 
 		 849 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  27.3 
 
 		 585 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  25.49 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  24.66 
 
 		 848 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  27.4 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  25.08 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  24.94 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  27.21 
 
 		 533 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  27.94 
 
 		 605 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.6 
 
 		 856 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  26.9 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.37 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  27.05 
 
 		 684 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  24.07 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  24.25 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  22.93 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  23.74 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  28.99 
 
 		 594 aa  70.1  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  26.28 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  25.84 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  26.27 
 
 		 521 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.36 
 
 		 853 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  23.82 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  26.67 
 
 		 619 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  23.2 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  26.77 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>