More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3176 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 484 aa  970    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  60.04 
 
 		 507 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  58.44 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  57.58 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  57.56 
 
 		 497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  41.62 
 
 		 558 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  36.87 
 
 		 566 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  46.1 
 
 		 564 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  34.46 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  33.93 
 
 		 549 aa  211  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  33.67 
 
 		 529 aa  210  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  37.36 
 
 		 388 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  34.18 
 
 		 391 aa  183  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  36.34 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  30.33 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  29.92 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  26.05 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  25.81 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  32.9 
 
 		 638 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  25.43 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  25.56 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  31.15 
 
 		 619 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  23.95 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  28.57 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  27.07 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  24.25 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  23.5 
 
 		 620 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  24.75 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  26.42 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.59 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  24.88 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  27.2 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.59 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 754 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  26.16 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  32.68 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 754 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.32 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.39 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.04 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  28.25 
 
 		 684 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  26.76 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  25.68 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  24.94 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.04 
 
 		 754 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  26.71 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  28.63 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  24.38 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  29.34 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  24.9 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  27.09 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  29.17 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 843 aa  67.4  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.24 
 
 		 752 aa  67  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  25.78 
 
 		 423 aa  67  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  26.67 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  30.3 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  26.46 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  28 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  24.69 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.4 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.01 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.92 
 
 		 762 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  24.48 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  29.49 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  29.36 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  24.27 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  25.32 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  31.58 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.14 
 
 		 755 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  23.21 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  24.95 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  25.21 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  23.69 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  25 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  25 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  24.64 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  29.15 
 
 		 613 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  24.82 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  28.16 
 
 		 585 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.41 
 
 		 735 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  29.15 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  24.29 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  29.15 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  24.04 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  25.36 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  27.93 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  29.83 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  25.65 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  25.52 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  25.38 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  27.31 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  24.91 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  22.99 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  26.85 
 
 		 493 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0599  protein-export membrane protein SecD  22.38 
 
 		 612 aa  60.1  0.00000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>